MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp25

Total Repeats: 390

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015922	T	7	7	209	215	0 %	100 %	0 %	0 %	343128167
2	NC_015922	A	6	6	216	221	100 %	0 %	0 %	0 %	343128167
3	NC_015922	T	8	8	243	250	0 %	100 %	0 %	0 %	343128167
4	NC_015922	ATTC	2	8	258	265	25 %	50 %	0 %	25 %	343128167
5	NC_015922	A	6	6	421	426	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
6	NC_015922	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
7	NC_015922	TAA	2	6	437	442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
8	NC_015922	TTA	2	6	460	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
9	NC_015922	TCT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
10	NC_015922	T	6	6	488	493	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
11	NC_015922	T	6	6	495	500	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
12	NC_015922	TCT	2	6	534	539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
13	NC_015922	TTTTCT	2	12	582	593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343128168
14	NC_015922	A	6	6	596	601	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
15	NC_015922	TCT	2	6	606	611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
16	NC_015922	TTA	2	6	630	635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
17	NC_015922	TAAA	2	8	665	672	75 %	25 %	0 %	0 %	343128168
18	NC_015922	AAG	2	6	715	720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128168
19	NC_015922	TTTCTT	2	12	760	771	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343128168
20	NC_015922	TCT	2	6	830	835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
21	NC_015922	AATA	2	8	875	882	75 %	25 %	0 %	0 %	343128168
22	NC_015922	T	6	6	884	889	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
23	NC_015922	AT	3	6	923	928	50 %	50 %	0 %	0 %	343128168
24	NC_015922	T	8	8	1062	1069	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
25	NC_015922	CTTT	2	8	1092	1099	0 %	75 %	0 %	25 %	343128168
26	NC_015922	A	6	6	1115	1120	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
27	NC_015922	TGA	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
28	NC_015922	ATT	2	6	1175	1180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
29	NC_015922	AAT	2	6	1313	1318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
30	NC_015922	T	6	6	1340	1345	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
31	NC_015922	AATTC	2	10	1362	1371	40 %	40 %	0 %	20 %	343128168
32	NC_015922	T	7	7	1537	1543	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
33	NC_015922	AT	3	6	1585	1590	50 %	50 %	0 %	0 %	343128168
34	NC_015922	CTTTT	2	10	1657	1666	0 %	80 %	0 %	20 %	343128168
35	NC_015922	CAC	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343128168
36	NC_015922	T	7	7	1776	1782	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
37	NC_015922	GAT	2	6	1807	1812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
38	NC_015922	TTTAT	2	10	1836	1845	20 %	80 %	0 %	0 %	343128168
39	NC_015922	TC	3	6	1919	1924	0 %	50 %	0 %	50 %	343128168
40	NC_015922	GGA	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343128168
41	NC_015922	TCCT	2	8	1955	1962	0 %	50 %	0 %	50 %	343128168
42	NC_015922	A	6	6	1991	1996	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
43	NC_015922	TAG	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
44	NC_015922	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
45	NC_015922	T	6	6	2023	2028	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
46	NC_015922	T	6	6	2032	2037	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
47	NC_015922	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
48	NC_015922	TTC	2	6	2195	2200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
49	NC_015922	TCT	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
50	NC_015922	TAG	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
51	NC_015922	T	6	6	2266	2271	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
52	NC_015922	GATA	2	8	2272	2279	50 %	25 %	25 %	0 %	343128168
53	NC_015922	TCT	2	6	2280	2285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
54	NC_015922	T	7	7	2311	2317	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
55	NC_015922	T	6	6	2346	2351	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
56	NC_015922	A	6	6	2360	2365	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
57	NC_015922	AG	3	6	2386	2391	50 %	0 %	50 %	0 %	343128168
58	NC_015922	ATG	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
59	NC_015922	GTG	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343128168
60	NC_015922	CTT	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
61	NC_015922	CAT	2	6	2569	2574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128168
62	NC_015922	TTC	2	6	2576	2581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
63	NC_015922	CTTT	2	8	2583	2590	0 %	75 %	0 %	25 %	343128168
64	NC_015922	T	7	7	2621	2627	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
65	NC_015922	A	6	6	2691	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
66	NC_015922	TTC	2	6	2759	2764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
67	NC_015922	TCA	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128168
68	NC_015922	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	343128168
69	NC_015922	AT	4	8	2852	2859	50 %	50 %	0 %	0 %	343128168
70	NC_015922	TAG	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
71	NC_015922	CTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
72	NC_015922	C	6	6	2936	2941	0 %	0 %	0 %	100 %	343128168
73	NC_015922	AGT	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
74	NC_015922	T	7	7	3069	3075	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
75	NC_015922	TTC	2	6	3104	3109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
76	NC_015922	ATT	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
77	NC_015922	TCT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
78	NC_015922	TCC	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343128168
79	NC_015922	TTA	2	6	3235	3240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
80	NC_015922	T	7	7	3241	3247	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
81	NC_015922	T	6	6	3261	3266	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
82	NC_015922	TCA	2	6	3273	3278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128168
83	NC_015922	A	8	8	3280	3287	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
84	NC_015922	AGA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128168
85	NC_015922	TTC	2	6	3323	3328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
86	NC_015922	AT	3	6	3360	3365	50 %	50 %	0 %	0 %	343128168
87	NC_015922	A	6	6	3371	3376	100 %	0 %	0 %	0 %	343128168
88	NC_015922	CTC	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343128168
89	NC_015922	TATCT	2	10	3410	3419	20 %	60 %	0 %	20 %	343128168
90	NC_015922	AT	4	8	3467	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	343128168
91	NC_015922	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
92	NC_015922	TC	3	6	3523	3528	0 %	50 %	0 %	50 %	343128168
93	NC_015922	T	6	6	3535	3540	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
94	NC_015922	TC	3	6	3608	3613	0 %	50 %	0 %	50 %	343128168
95	NC_015922	TAAA	3	12	3627	3638	75 %	25 %	0 %	0 %	343128168
96	NC_015922	TTC	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
97	NC_015922	TTC	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
98	NC_015922	AT	3	6	3699	3704	50 %	50 %	0 %	0 %	343128168
99	NC_015922	T	6	6	3706	3711	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
100	NC_015922	TA	3	6	3802	3807	50 %	50 %	0 %	0 %	343128168
101	NC_015922	TCT	2	6	3813	3818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
102	NC_015922	ATT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
103	NC_015922	T	8	8	3912	3919	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
104	NC_015922	CTT	2	6	3922	3927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128168
105	NC_015922	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
106	NC_015922	AGT	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128168
107	NC_015922	TGT	2	6	4020	4025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128168
108	NC_015922	AAT	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
109	NC_015922	GTC	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128168
110	NC_015922	GAA	2	6	4104	4109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128168
111	NC_015922	GTTT	2	8	4111	4118	0 %	75 %	25 %	0 %	343128168
112	NC_015922	T	6	6	4116	4121	0 %	100 %	0 %	0 %	343128168
113	NC_015922	TTA	2	6	4146	4151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128168
114	NC_015922	TAA	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128168
115	NC_015922	TTGT	2	8	4209	4216	0 %	75 %	25 %	0 %	343128168
116	NC_015922	TAAAT	2	10	4798	4807	60 %	40 %	0 %	0 %	343128169
117	NC_015922	ATT	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128169
118	NC_015922	A	6	6	4885	4890	100 %	0 %	0 %	0 %	343128169
119	NC_015922	A	6	6	4894	4899	100 %	0 %	0 %	0 %	343128169
120	NC_015922	TAC	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128169
121	NC_015922	AAC	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128169
122	NC_015922	A	8	8	4921	4928	100 %	0 %	0 %	0 %	343128169
123	NC_015922	CAA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128169
124	NC_015922	A	8	8	4957	4964	100 %	0 %	0 %	0 %	343128169
125	NC_015922	A	6	6	4996	5001	100 %	0 %	0 %	0 %	343128169
126	NC_015922	TCAAA	2	10	5042	5051	60 %	20 %	0 %	20 %	343128169
127	NC_015922	A	6	6	5085	5090	100 %	0 %	0 %	0 %	343128169
128	NC_015922	ATT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128169
129	NC_015922	A	8	8	5224	5231	100 %	0 %	0 %	0 %	343128169
130	NC_015922	GAAAAA	2	12	5255	5266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	343128169
131	NC_015922	AT	3	6	5400	5405	50 %	50 %	0 %	0 %	343128169
132	NC_015922	TAC	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128169
133	NC_015922	AC	3	6	5446	5451	50 %	0 %	0 %	50 %	343128169
134	NC_015922	AAAAC	2	10	5470	5479	80 %	0 %	0 %	20 %	343128169
135	NC_015922	CTA	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128169
136	NC_015922	TAAAT	2	10	5825	5834	60 %	40 %	0 %	0 %	343128170
137	NC_015922	ATT	2	6	5835	5840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128170
138	NC_015922	ATT	2	6	5850	5855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128170
139	NC_015922	ACA	2	6	5856	5861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128170
140	NC_015922	GTT	2	6	6821	6826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128171
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267	NC_015922	TA	3	6	13685	13690	50 %	50 %	0 %	0 %	343128179
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271	NC_015922	TGTT	2	8	13782	13789	0 %	75 %	25 %	0 %	343128179
272	NC_015922	TGT	2	6	13820	13825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128179
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.